Факультет автоматики был организован в 1960 году и в 1966 году был сделан первый выпуск, всего факультет сделал 33 выпуска.

Инженеры, закончившие факультет автоматики, работают на судах всех типов и плавают в различных судоходных компаниях, в том числе под иностранными флагами.

Изучение фундаментальных дисциплин расширяет кругозор курсантов и способствует формированию навыков понимания сущности всех процессов эксплуатации судовых энергетических установок, что обеспечивает высокий профессиональный уровень факультета.

Профессорско-преподавательский состав факультета в совершенстве владеет современной методикой преподавания и отдаёт много сил работе с молодёжью.

На факультете имеется три кафедры, которые полностью обеспечивают всех курсантов приобретением необходимых современному морскому инженеру знаний, навыков и умений.